Vejen til R er belagt med ..... R Commander?

Mange af mine kolleger spørger hvad det bedste statistik program er til at udføre analyse x. Eller til alle de analyser der er relevante for deres projekt/studie/phd-forløb osv. Ofte bliver jeg svar skyldig. Jeg ved ikke hvad det bedste program er til enhver givet analyse, eller hvad der er det bedste "general-purpose" statistik program. Der er mange grunde til denne mangel hos mig. Den vigtigste er nok at jeg kun har prøvet ganske få af de mange produkter der er til rådighed. Men selv blandt de jeg har prøvet er det svært for mig at sige, hvad der er bedst, så klog føler jeg mig slet ikke, og bedst til hvad i øvrigt? Hvad jeg kan svare på er hvad jeg selv foretrækker, eller mere relevant for de som spørger, hvad jeg kan hjælpe med og på hvilket niveau.

Her kommer vi så til en ny afgrund af problemer. Jeg bruger en pæn del af min arbejdstid på at udføre analyser på mange skiftende projekter, og forsøger til tider at tilpasse analyserne til nogle specifikke behov. Jeg har semi-committet min indsats til at arbejde med R og LaTeX for at arbejde hurtigt og konstistent med mine projekter i et veldefineret, flexibelt og dokumenteret workflow. Det er midlertid næppe relevant for den gennemsnitlige phd-studerende på hospitalet. Dels fordi de arbejder med langt færre projekter, projekter der ofte kan klares med standard analyser og især pga. den læringskurve der skal bestiges før min foretrukne løsning bliver produktiv. Så vidt jeg ved, altså. For en, eller et par, ad-hoc analyser er en klik-og-peg løsning måske det bedste. SAS, SPSS GraphPadPrism og hvad de hedder alle sammen har intuitive brugerflader, og for de to førstes vedkommende også mulighed for at gå stadig dybere efterhånden som behov og kompetencer udvikler sig. I praksis er de fleste der har henvendt sig med spørgsmålet endt med at bruge SAS fordi det er tilgængeligt på hospitalet, har hele to klik og peg interfaces og er anerkendt som et professionelt statistikværktøj. Nogle få er blevet ved SPSS og andre få bruger GraphPadPrism, eller hvodden det nu staves. Jeg har hidtil været meget tilbageholdende med at anbefale R fordi jeg ikke har haft noget kendskab til de bud der har været på klik-og-peg løsninger.

Nu har jeg imidlertid haft den fornøjelse at vejlede en medicin-studerende som gerne ville bruge R på sin Ubuntu maskine. Vi endte med at forsøge os med R Commander af John Fox. Erfaringerne har været rigtig gode, og jeg har bestemt mod på mere. Så i fremtiden vil jeg foreslå R som et godt bud på et statistik program for alle. Jeg har også planer om at udbyde et kort kursus i R og R Commander på hospialets forskningscenter.

I en kommende blog vil jeg komme ind på hvorfor det ikke er ligegyldigt om man starter det rigtige sted med sine statistiske anstrengelser.